Все зависит от того, будете ли вы там жить или нет. Идеально бы было квартиру освободить. В таком случае разделите ремонт на основные этапы:
1)Электрика
2)Сантехника
3)Потолки и стены
4)Пол
Лучше эти этапы делать во всей квартире сразу. Вариант ремонта "по комнатам" подходит только в том случае, если электрика и сантехника у вас в порядке. Тогда можно в квартире и жить.